纳米孔测序可以降低DNA分析成本

   日期:2019-04-16     浏览:7    评论:0    
核心提示:在过去的5年里,研究人员一直在探索利用纳米孔作为核酸测序工具。从理论上讲,当一段DNA穿过小孔时,这些小孔应该会对四个核苷酸
在过去的5年里,研究人员一直在探索利用纳米孔作为核酸测序工具。从理论上讲,当一段DNA穿过小孔时,这些小孔应该会对四个核苷酸碱基中的每一个产生独特的反应特性。


现在,英国牛津纳米孔技术公司(Oxford Nanopore Technologies)的研究人员已经成功测试了一个系统,该系统可以在DNA片段穿过修饰过的蛋白质纳米孔时,直接识别其碱基。牛津大学首席执行官Gordon Sanghera博士说,随着进一步的发展,该系统将大大减少当前扫描方法所需的昂贵设备、化学药品和实验室时间。

“从几天到几个小时,你都能得到同样的信息,所需的设备也简单得多,”桑赫拉博士说。

目前大多数的DNA测序仪都使用荧光化学标签,将构成DNA序列中“字母”的四种化学物质分别附在标签上。精密的摄像机和软件读取标签来识别基因。相比之下,这些牛津大学的科学家在《自然纳米技术》杂志上描述的系统则是通过一个微小的生物工程孔,即“纳米孔”,一次发送一个字母的DNA。通过小孔的电流对基因密码中的四个字母的反应各不相同,这使得科学家能够准确地读出每个字母。

美国国家人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute)测序技术项目主任杰弗瑞·施洛斯(Jeffery Schloss)博士说:“我认为,通过纯粹的电子信号就能区分四个碱基,这是一个令人难以置信的进步。”

自从人类基因组计划在2003年以3亿美元完成其基因图谱以来,测序技术的进步一直非常迅速。目前的费用在10万美元左右徘徊,尽管联邦政府承诺投入数百万美元用于DNA测序研究,希望到2014年能实现1000美元的基因组扫描。牛津大学认为,它的纳米孔测序技术可能是1000美元扫描技术的有力竞争者。然而,到目前为止,该公司只使用纳米孔读取单个DNA字母。该公司仍在努力改进扫描整个DNA链的系统。

本文详细介绍了单分子纳米孔DNA测序的连续碱基鉴定。牛津大学的研究人员也参与了这项研究。这篇论文的摘要可在该杂志的网站上找到。
 
打赏
 
更多>同类资讯
0相关评论

推荐图文
推荐资讯
点击排行